알파폴드: AI 신약개발 혁신
남궁석 지음 / 바이오스펙테이터 / 2024년 3월
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딥마인드가 꾸준히 단백질 구조 예측 연구를 하던 학계 연구팀에 비해 압도적인 결과를 낼 수 있었던 비결은 무엇일까? 이는 알파폴드2가 매우 다양한 시도가 포함된 단백질 구조 예측을 위한 새로운 딥러닝 시스템이라는 점에 있다(p221)... 한편 딥마인드는 오랫동안 딥러닝 및 단백질 구조 연구를 수행해 온 경험 많은 연구자로 대규모 연구팀을 꾸렸다. 여기에 구글의 방대한 컴퓨팅 자원을 자유롭게 사용할 수 있다는 것도 큰 격차를 불러왔을 것이다. _ 남궁석, <알파폴드 : AI 신약개발 혁신>, p223

<알파폴드 : AI 신약개발 혁신>은 독자들에게 최근 AI혁명이 바이오산업에 가져온 혁신과 변화를 알려준다. 아미노산 서열과 같은 1차 구조, 알파 나선과 베타 병풍 구조 등의 2차 구조, 2차 구조들의 접힘을 통해 이루어지는 3차 구조와 화학적 상호작용 등에 의한 단백질 기능 결정은 단백질 구조를 파악하고 예측하는데 큰 장애였다. 이를 전자현미경 등 장비 기술의 발전과 AI를 활용한 추론으로 극복하고 있는 단백질 연구와 신약개발의 현황을 <알파폴드 : AI 신약개발 혁신>은 잘 보여준다.

1990년대 후반에 3D 게임이 등장하자 3D 그래픽을 처리하기 위해 GPU가 만들어졌고, GPU가 3D 그래픽 처리 외에도 행렬연산 등을 CPU보다 훨씬 빠르게 처리하자 과학 기술 분야에서 계산이 필요할 때도 쓰이기 시작했다. 결과적으로 이는 2010년대 이후 '딥러닝(Deep Learning)으로 대표되는 인공지능의 비약적인 발전의 물적 기반이 되었다. _ 남궁석, <알파폴드 : AI 신약개발 혁신>, p198

바이오 산업에서 이러한 변화를 가져온 것은 AI 혁명의 결과임은 분명하다. 그렇지만, 알파폴드의 성공에서 우리가 주목해야 할 것은 AI의 가능성에 그치지 않는다. 이러한 연구를 성공할 수 있었던 배경 중 하나로 보다 전문화된 인력의 대규모 투입임을 간과해서는 안된다. AI의 대표적인 문제점인 할루시네이션(Hallucination) 검증을 위해서 이전보다 전문연구원의 투입이 요구되며 이는 알파폴드의 산출물의 품질과 직결된다. 이러한 점을 고려해본다면, AI시대에도 여전히 19세기와 같은 자본재와 노동의 결합이라는 자본주의 생산구조는 유효하다고 볼 수 있지 않을까. 결합되는 노동력과 자본재의 내용은 달라지겠지만.

효율적인 DNA 서열 결정이 가능해지면서 이후 DNA에 근거하여 유전자의 염기 서열을 결정할 수 있게 되었다. 또한 특정한 유전자가 만들어 내는 단백질의 아미노산 서열 역시 유전자 암호를 번역하여 얻을 수 있게 되었다... 단백질 서열 결정법의 개발은 단백질의 가장 중요한 정보인 단백질이 어떤 아미노산 순서로 되어 있는지 손쉽게 파악하는 계기가 되었다. _ 남궁석, <알파폴드 : AI 신약개발 혁신>, p46

<알파폴드 : AI 신약개발 혁신>은 딥마인드와 알파폴드의 사례를 통해 AI시대의 혁신과 변화가 이전과는 얼마나 다른지 그리고 얼마나 큰 것인지 보여준다. 그와 동시에 자본재와 노동의 결합이라는 기본적 틀은 달라지지 않았다는 점에서 AI 혁명의 구조적 한계 그리고 결합 내용의 변화에 대응하기 위한 과제를 단백질 연구와 신약개발이라는 바이오 산업을 통해 보여주는 책이라 생각한다...

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미국의 기준금리인하가 유력한 가운데 한국 금융시장과부동산시장의 리스크가 어느 방향으로 치달을지도 예측하기 어렵다. 반도체 등IT 부문의 수출은 원활할 것으로 기대되고 있으나, 한국이 통제할 수 있는 사안은 아니다. 글로벌 반도체 시장은 원래 변동성이 큰 데다 올 하반기엔 인공지능 기술의 전망에 대한 시장의 판단에 따라 호황과 불황이 극단적으로 갈릴 수 있다. - P28

보수층은 정부의 한·일 역사 문제 오다른 이슈 대응에서도 윤석열 정부에 비슷한 정도의 불신을 드러냈다. 그러나 보수층이 역사 문제에 대한 ‘우클릭‘을 ‘실정‘에 가까운 다른 사회 현안 대응과 비슷하게 평가한다는 사실은 그 자체로 주목할 만하다. 이념을 앞세운 전통적 지지층집결이 지금까지 별다른 성과를 거두지 못하고 있다는 의미다. - P36

기술은 빠르게 발전하고 있다. 가속화된 기술개발 위에 성범죄자들이 자꾸만 올라타지만, 그만큼 방어 기법과 추적기술도 유의미한 결과물을 내는 중이다. 중요한 건 이러한 연구와 기술들을 실제수사와 서비스에 적용할 수 있도록 끈질기게 요구하는 것, 또한 이러한 기술이 있는 만큼 가해자들은 꼭 붙잡히고 확실하게 처벌될 것이라고 인식시키는 것이다. - P49


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중세의 가을
요한 하위징아 지음, 이희승맑시아 옮김 / 동서문화동판(동서문화사) / 2016년 11월
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요한 호이징가 지음, 최홍숙 옮김 / 문학과지성사 / 1997년 5월
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문화사의 과제
요한 호이징하 지음, 김원수 옮김 / 아모르문디 / 2016년 3월
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에라스뮈스- 광기에 맞선 인문주의자
요한 하위징아 지음, 이종인 옮김 / 연암서가 / 2013년 8월
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중세의 가을
요한 하위징아 지음, 이종인 옮김 / 연암서가 / 2012년 8월
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 이 모든 사상의 기반은 다음과 같다. 즉, 귀족은 기사도의 이상을 실천함으로써 이 세상을 지탱하고 정화할 의무가 있다. 귀족의 진실한 생활과 귀족의 진실한 미덕은 사악한 시대에 대한 치유책이다. 교회와 왕국의 안녕과 평온, 정의의 힘은 귀족에게 달려 있다... 하느님의 의지로 이 세상에는 두 가지 것이 주어졌다. 그것은 신성한 법과 인간의 법을 지탱하는 두 기둥이다. 그것이 없다면 이 세상은 일대 혼란으로 빠져들 것이다. 그 두 기둥은 기사단과 학자들이다. _ 요한 하위징아, <중세의 가을>, p139


  선(善)과 악(惡), 성(聖)과 속(俗), 교회와 왕정, 성직자와 귀족, 천상의 법과 지상의 법에 의해 유지되는 중세(中世)라는 이분법(二分法)의 시대. 그 중에서도 요한 하위징아의 <중세의 가을>은 14~15세기 부르고뉴 공국의 역사와 문화를 통해 중세 문명의 시기를 조망한다. 


 몰아 감각은 커다른 위험을 가져온다. 이것은 기독교의 신비가들뿐만 아니라 인도의 신비주의자들이 도달한 결론이었다. 그 위험의 구체적 내용은 이러하다. 완벽하게 신을 명상하고 관조하고 사랑하는 온전한 영혼은 결코 죄를 지을 수 없다. 신에 몰입하면, 자신의 의지는 더 이상 없고, 남은 것은 오로지 신의 의지뿐이다. 그리하여 몰아 상태에서 육욕에 사로잡히더라도 그 육욕은 죄가 되지 않는다. _ 요한 하위징아, <중세의 가을>, p375


 저자는 <중세의 가을>에서 예술 작품을 통해 그들의 내면 세계를 들춰낸다. 철학이 신학의 시녀였던 것처럼, 감성은 이성에 의해 제한되었다. 지나친 정념과 표현은 죄악으로 간주되는 시기였기에 인간의 감성(感性)은 신앙의 엑스터시를 표현하는 경우에 한해 허용되었고 이러한 제한과 억눌림은 하위징아가 중세를 모순과 갈등의 시기로 바라보는 관점 중 하나가 된다. 


 삶의 아름다움을 인식하는 태도에서 커다란 분수령이 있다면, 중세와 르네상스의 간극보다는 르네상스와 근대의 간극이 더 깊고 크다고 보아야 한다. 대체로 보아 예술과 인생이 서로 갈라지는 지점에서 하나의 방향 전환이 발생한다. 그 지점에서, 예술은 더 이상 인생의 즐거움을 이루는 고상한 것으로서 인생의 한 가운데 있지 않고, 인생 바깥에 초연히 위치하여 멀리서 감상하는 어떤 것이 된다. 그리하여 사람들은 예술을 교육과 휴식의 순간에만 바라보며 높이 숭앙하는 어떤 것으로 취급한다. 이렇게 하여 하느님과 세상을 구분하는 저 오래된 2원론이, 예술과 인생의 구분이라는 또 다른 형식으로 등장했다. _ 요한 하위징아, <중세의 가을>, p95


 그렇지만, 하위징아에게 중세는 모순과 갈등의 시기로 그치지 않는다. 억눌림과 제약이 심할수록 마치 페스트를 피해 교외로 나가 젊은 남녀들이 이야기를 나누면서 어두운 현실을 피하듯, 중세의 어두움에는 빛의 씨앗도 함께 있음을 <중세의 가을>은 보여준다. 이런 면에서 <중세의 가을>의 전체 구조는 이분법이다. 그렇지만, 그 이분법마저 다음 시대로 나아가는 하나의 기둥이 되는데, 이렇게 본다면 동시에 탈(脫)이분법이기도 하다. 중세 뿐 아니라 책의 구조마저 모순적으로 보여지는 이러한 부분을 어떻게 해석해야 할까.


 안전, 한적, 독립은 인생을 즐겁게 하는 좋은 것들이고, 그 때문에 사람들은 궁정 생활을 피하여 자연 속에서 노동과 절제의 단순한 생활을 영위하려고 했다. 이것은 단순한 생활이라는 이상의 부정적 측면이다. 긍정적 측면은 단순함과 노동의 향유라기보다는 자연을 사랑하는 데서 오는 안락함이다. _ 요한 하위징아, <중세의 가을>, p220


 앞에서 언급한 것처럼<중세의 가을>에서 하위징아는 백년전쟁 전후로 부흥했던 부르고뉴 공국의 역사와 문화를 통해 시대를 규정한다. 지리적으로 잉글랜드와 프랑스 사이에서 강성했지만 불과 백여년 존속했던 부르고뉴공국. 더운 여름과 추운 겨울이 사이에 있는 가을처럼, 부르고뉴의 지리와 역사 자체가 가을이 아닐까. 네덜란드어 판 서문은 이 시기를 바라보는 저자의 관점을 보다 명확하게 설명한다.


 이 책은 14세기와 15세기라는 중세 후기를 조망하고 있지만 그 시대를 르네상스의 안내자로 바라보는 것이 아니라, 중세의 마지막 시기, 세 사상의 마지막 단계라는 관점에서 살펴보고 있다. 나무로 친다면 이 시대는 열매가 농익어서 완전히 만개하고, 또 땅에 막 떨어지려는 그런 시대이다. 과거의 주도적 형식들이 화려하게 개발되어 사상의 핵심을 제압하고, 또 예전의 타당했던 사상들을 경직시켜 고사시키던 그런 시대이다. 중세 후기를 하나의 독립된 시대로 파악하는 것, 그것이 이 책의 주된 내용이다. _ 요한 하위징아, <중세의 가을>, p24, 네덜란드어 판 서문


 이전 시대인 중세 전/중기와 이후 시대인 르네상스 시대와 구분되는 별도의 시기 중세 후기. 독자들은 중세와 르네상스 사이의 변화의 싹을 중세 후기라는 시대적 한계를 통해 발견한다. 그리고 부르고뉴라는 공간적 제약 안에서 또 다른 변화의 씨앗이 자리함을 짐작하게 된다. 만약 하위징아가 자신의 고국인 네덜란드를 무대로 중세의 역사를 썼다면, <중세의 가을>은 11월의 가을이 아닌 음력 8월의 한가위 같은 느낌이 나지 않았을까.


 <중세의 가을>은 독립된 시대로서 중세 후기를 돌아보게 한다. 그리고, 이러한 중세 후기를 특징짓는 것은 이전/이후 시대와 구분되는 이분법의 모순이지만, 동시에 <중세의 가을>이 주제로 한 시간적, 공간적 한계는 오히려 이분법 구조를 넘어서 탈(脫)이분법적으로 시대를 전망케 하는 매력을 가진 작품이라 여겨진다...


  그것은 사악한 세계였다. 증오와 폭력의 불길이 거세게 불타올랐다. 악은 강력하다. 악은 그 검은 날개로 이미 어두워진 대지를 덮는다. 곧 세계의 종말이 오리라고 기대되었다. 하지만 사람들은 회개하지 않았고, 교회는 계속 허덕거렸으며, 설교자들과 시인들은 말세를 경고하고 탄식했지만 아무도 들어주지 않았다. _ 요한 하위징아, <중세의 가을>, p80


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바이오테크 시대
제레미 리프킨 지음, 전영택 외 옮김 / 민음사 / 1999년 5월
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이제 저물어가는 금세기가 물리학과 원자력 기술의 시대였다면 다가오는 새 세기는 생물학의 세기가 될 것이다. 그리고 가장 중요한 기술은 유전공학 기술이 될 것이다._ 제러미 리프킨, <바이오테크 시대>, p198/235

20세기 말 제러미 리프킨는 다음 세기의 기술의 중심은 바이오 기술이 될 것으로 전망하는데, <바이오테크 시대>는 이제는 현실이 된 '생명공학 시대'의 저자의 기대와 우려가 함께 담겨있다. 이제는 거의 1/4세기 전에 씌여진 책이기에 책에서 제시하는 예시가 마치 레이첼 카슨의 <침묵의 봄>처럼 지난 시대의 이야기처럼 느껴지는 것은 사실이다. 이런 한계에도 불구하고 <바이오테크 시대>가 제시하는 관점은 빠르게 변화하는 시간의 흐름 안에서는 미처 깨닫지 못했던 점을 일깨운다.

유럽이 광대한 토지를 엔클로우징하고 공유지를 사유 부동산으로 전환시킨 이후, 5세기에 걸쳐 전세계의 공유지도 사유화의 길을 걸었다. 오늘날 지구상의 모든 땅이 구획되어 개인 소유물이 되거나 정부의 통제하에 있다(p43)... 거의 1세기 동안에 걸쳐 전세계의 종자를 영리 목적을 위해 엔클로우저하고 사유화하는 행위를 언론은 지나치듯 보도하는 것 외에는 관심을 갖지 않는다. 그럼에도 불구하고 이는 현대사에 있어서 중요한 발전의 하나이다. _ 제러미 리프킨, <바이오테크 시대>, p103/235

저자는 <바이오테크 시대>를 통해 제약/바이오 회사의 지적 독점권과 이로 인한 부작용을 우려한다. 근대 초 잉글랜드에서의 엔클로저(Enclosure) 운동과 마찬가지로 공적 자산의 사유화되고 특허권을 통해 진입장벽이 세워지면서 새로운 세기의 부(富)가 바이오테크로 집중된다는 것이다. 그리고, 이러한 유전공학의 발전을 통해 우생사회학이 보편적 이념으로 받아들여지는 것에 대한 우려점이 본문을 통해 표현된다.

유전공학의 비약적 발전과 함께 우생사회학(eugenic sociology)이 발전하고 있다. 이 새로운 사회학은 우생 사회가 출현할 수 있는 문화적 토양을 조성하는 데 도움을 준다. 사회생물학(sociobiology)은 하버드 대학과 기타 다른 고등교육 기관에서 그 학문적 토대가 형성되어 유전자 시대의 사회적 조정자로서의 역할을 하게 되었다(p131)... 유전자 차별은 다른 기관에까지 확대되기 시작하고 있다. 학업 성취 능력에 있어서 유전 형질의 역할에 관한 애매모호한 생각이나 오해에 근거하여 학교에서 어린이들에 등급을 매기고 서로 분리하여 차별하는 사례가 점점 증가하고 있다. _ 제러미 리프킨, <바이오테크 시대>, p145/235

코로나를 거치면서 본격적으로 바이오 산업이 발전했고, 이러한 최근 연구결과와 영향은 <바이오테크>에는 담겨있지 않다. 그렇지만, 최근 바이오산업의 동향을 보면서 이미 오래전에 제기한 비판점에 대해 다시 생각하게 된다. 키트루다(Keytruda)를 비롯한 면역항암제들은 암(癌)으로 고통받는 많은 환자들에게 치료의 길을 열어주었다는 점에서 바이오테크는 분명 긍정적인 영향을 끼쳤다. 그렇지만, 이와 함께 최근 우리 사회에 불어닥친 비만치료제에 대한 과도한 관심은 본문에서 제기된 저자의 '우생사회학'에 대한 우려를 떠올리게 한다.

바이오테크 기술은 건강하고 오래살기를 원하는, 무병장수(無病長壽)의 삶을 원하는 인간의 오랜 바람을 이루기 위해 반드시 필요한 기술임은 분명하다. 그렇지만, <은하철도 999>에서 철이가 원했던 불멸불사의 기계인간이 되기 위한 열차탑승권, 소수의 인간만이 행복한 엘리시움(Elysium)으로 안내하는 그런 모습이 과연 바람직할까. 특허권을 통해 치료제 개발 시 제약/바이오 사에게 돌아가는 막대한 이윤은 벤처캐피탈로서 승자독식의 자본주의 면모를 분명하게 보여준다. 그 결과 많은 희귀병 환자들에게 새로운 삶의 길이 보여졌다는 점은 긍적적이지만, 많은 이들이 식량과 예방접종의 부족으로 인해 제대로 치료받지 못하고 죽어가고 있는 가운데 이러한 예방조치에 대한 관심은 신약개발만큼 주목받지 못한 것이 오늘날의 현실이고, 그 이유가 돈이 되지 않기 때문임을 생각하면 씁쓸함이 남는다...

관련기사 : https://n.news.naver.com/article/016/0002360029
살빠지는 줄 알았더니... '노화까지 늦춘다' 기적의 '약' 한국상륙

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